Đảng bộ Trường Đại học Giao thông vận tải được hình thành và phát triển từ chi bộ đầu tiên thành lập năm 1949, chỉ vài năm sau khi Trường Cao đẳng Giao thông Công chính, tiền thân của Trường Đại học Giao thông vận tải ngày nay, được khai giảng (15/11/1945).

Trong quá trình xây dựng và trưởng thành, Đảng bộ Trường là Đảng bộ cơ sở ba cấp, từng trực thuộc Thành ủy Hà Nội, Đảng ủy Giao thông Trung ương và Đảng ủy Khối các cơ quan Trung ương. Sự phát triển của Đảng bộ luôn gắn liền với sự phát triển của Nhà trường.

Ngày 24/02/1961, Ban Thường vụ Đảng ủy Bộ Giao thông ban hành Quyết định số 26/QĐ-ĐU thành lập Đảng bộ Đại học Giao thông với 5 chi bộ và 96 đảng viên; đồng thời chỉ định Ban Chấp hành Đảng bộ gồm 3 đồng chí: đồng chí Bùi Thu giữ chức Bí thư, đồng chí Lê Quý An và đồng chí Nguyễn Văn Vịnh là Ủy viên. Ngày 12/01/1962, Đảng bộ tổ chức Đại hội đại biểu lần thứ nhất, sự kiện mang ý nghĩa lịch sử, đánh dấu sự ra đời chính thức của Đảng bộ Trường Đại học Giao thông vận tải.

Sau khi Thủ tướng Chính phủ ban hành Quyết định thành lập Trường Đại học Giao thông vận tải (24/3/1962), Đảng bộ Trường tổ chức Đại hội nhiệm kỳ II vào ngày 29/3/1963. Đây là Đại hội đầu tiên của Đảng bộ sau khi Trường được thành lập chính thức theo quyết định của Chính phủ.

Tính đến nay, Đảng bộ Trường đã trải qua 31 kỳ Đại hội; có 15 đồng chí đã và đang đảm nhiệm chức vụ Bí thư Đảng ủy, gồm: Bùi Thu (1961–1963), Nguyễn Kha (1963–1966), Nguyễn Thành Đính (1966–1967), Nguyễn Đức Bảng (1967–1972), Trần Y (1972–1975), Ngô Tiến Tập (1975–1982), Lê Xuân Thụ (1982–1986), Cẩm (1986–1990), Nghiêm Văn Dĩnh (1990–2001), Lê Văn Học (2001–2005), Trần Tuấn Hiệp (2005–2010), Trần Đắc Sử (2010–2016), Nguyễn Duy Việt (2016–2020), Nguyễn Thanh Chương (từ năm 2020 đến nay). Dưới đây là danh sách Ban chấp hành Đảng bộ Trường, nhiệm kỳ 2025-2030:

Từ khi thành lập đến nay, Đảng bộ Trường Đại học Giao thông vận tải luôn phát huy tinh thần đoàn kết, giữ vững vai trò lãnh đạo toàn diện đối với mọi hoạt động của Nhà trường.

Phát huy truyền thống hơn 80 năm xây dựng và phát triển, Đảng bộ Trường tiếp tục đổi mới và chỉnh đốn Đảng theo chiều sâu; lãnh đạo Nhà trường phấn đấu trở thành trung tâm đào tạo, nghiên cứu khoa học và chuyển giao công nghệ đa ngành, đa lĩnh vực, góp phần thiết thực vào sự nghiệp công nghiệp hóa, hiện đại hóa đất nước và sự phát triển của ngành giao thông vận tải.